Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm6S4R1W5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm6S4R1W5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm6S4R1W5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm6S4R1W5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm6S4R1W5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms