Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knop1Q9Z2Q2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knop1Q9Z2Q2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms