Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d3cQ9QZS8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d3cQ9QZS8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh2d3cQ9QZS8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d3cQ9QZS8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms