Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a4Q9QZR9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col4a4Q9QZR9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a4Q9QZR9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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