Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms