Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AatfQ9JKX4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AatfQ9JKX4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms