Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bco1Q9JJS6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco1Q9JJS6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Bco1Q9JJS6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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