Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl28Q9JIL2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms