Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgshQ9EQ08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms