Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fip1l1Q9D824 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fip1l1Q9D824 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms