Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Capn9Q9D805 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn9Q9D805 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms