Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp4Q9D4F8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp4Q9D4F8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms