Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chordc1Q9D1P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.1 ms