Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610524H06RikQ9CZU9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
2610524H06RikQ9CZU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610524H06RikQ9CZU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610524H06RikQ9CZU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms