Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shisa9Q9CZN4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms