Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis18aQ9CZJ6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis18aQ9CZJ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms