Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem50aQ9CXL1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem50aQ9CXL1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms