Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp23Q9CX11 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp23Q9CX11 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms