Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d3Q9CSV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms