Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Use1Q9CQ56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Use1Q9CQ56 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Use1Q9CQ56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Use1Q9CQ56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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