Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99M08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99M08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q99M08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q99M08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q99M08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q99M08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q99M08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99M08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99M08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99M08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99M08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99M08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99M08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99M08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99M08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99M08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q99M08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q99M08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99M08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99M08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99M08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99M08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99M08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99M08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99M08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99M08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99M08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q99M08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q99M08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q99M08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms