Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms