Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn8Q91VA3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn8Q91VA3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms