Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd1aQ8VEF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd1aQ8VEF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd1aQ8VEF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms