Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol9aQ8VDU3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol9aQ8VDU3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol9aQ8VDU3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol9aQ8VDU3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol9aQ8VDU3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol9aQ8VDU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms