Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox30Q8CGW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox30Q8CGW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157 ms