Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Apol7cQ8C6E1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7cQ8C6E1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms