Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ubqln3Q8C5U9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubqln3Q8C5U9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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