Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cwc22Q8C5N3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms