Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUP8

Fam43a, Protein FAM43A, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43aQ8BUP8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43aQ8BUP8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43aQ8BUP8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms