Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg4dQ8BGV9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms