Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZM7

Gtf2a2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a2Q80ZM7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2a2Q80ZM7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a2Q80ZM7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a2Q80ZM7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a2Q80ZM7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a2Q80ZM7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms