Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR4

Znf598, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF598, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf598Q80YR4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf598Q80YR4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Znf598Q80YR4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf598Q80YR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf598Q80YR4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf598Q80YR4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms