Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ckap2lQ7TS74 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ckap2lQ7TS74 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms