Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HhipQ7TN16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HhipQ7TN16 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HhipQ7TN16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HhipQ7TN16 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HhipQ7TN16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HhipQ7TN16 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms