Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TwistnbQ78WZ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms