Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc1Q6TDU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc1Q6TDU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms