Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt3Q6PE13 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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