Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg16l2Q6KAU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms