Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn11Q6J756 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn11Q6J756 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms