Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf8Q6DID3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf8Q6DID3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms