Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Git1Q68FF6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Git1Q68FF6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Git1Q68FF6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms