Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc8eQ66JT1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc8eQ66JT1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms