Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sf3a2Q62203 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms