Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtcfQ61164 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtcfQ61164 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtcfQ61164 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtcfQ61164 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtcfQ61164 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtcfQ61164 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtcfQ61164 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms