Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap4Q60662 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap4Q60662 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Akap4Q60662 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap4Q60662 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap4Q60662 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap4Q60662 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap4Q60662 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms