Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bbs12Q5SUD9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms