Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5730522E02RikQ5SP45 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
5730522E02RikQ5SP45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms