Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms