Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkaa1Q5EG47 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms